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French Pages 80 Year 2021
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Un virus, des canards et des hommes
« Aujourd’hui, 13 juillet 1510, il ne reste plus un poulet sur la place du marché, ils ont tous, ou la majorité, été achetés pour des gens malades* qui sont à Modena ; ceux-ci ont une maladie qui dure trois jours avec une forte fièvre et des maux de tête, puis ils se remettent, mais continuent d’avoir une toux horrible qui dure peut-être huit jours, avant de s’en libérer peu à peu. » Tommasino De Bianchi, XVIe siècle (première description écrite d’une possible pandémie grippale)
* Le bouillon de poule était considéré à l’époque comme un remède contre la grippe et d’autres maladies respiratoires.
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UN POSSIBLE COMMENCEMENT
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LES VIRUS : DES MICROBES PAS COMME LES AUTRES
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DES CRÉATURES AUX FRONTIÈRES DE LA VIE Contrairement aux agents infectieux précédemment décrits, les virus ne sont pas constitués de cellules. De ce fait, ils ne sont pas vraiment vivants, mais ne sont pas vraiment inertes non plus. Les virus sont aux frontières du vivant. Un virus, c’est quoi exactement ?
Des parasites de nos cellules
Un virus est une particule microscopique,
Si un virus est si petit, c’est qu’il n’emporte avec
constituée de gènes entourés par une coque
lui que le strict minimum : il a impérativement
de protéines (la capside), incapable de se
besoin d’une cellule pour pouvoir se multiplier.
multiplier seule. On classe les virus selon deux
On parle de parasite intracellulaire obligatoire.
caractéristiques principales :
Certaines protéines à sa surface jouent le rôle
– La nature de leur génome, qui peut être
de clef permettant d’ouvrir les serrures des
constitué d’ADN ou d’ARN. L’ARN est moins
cellules dans lesquelles il peut entrer. Tous
stable que l’ADN, ce qui permet aux virus à ARN
les virus n’ont pas les mêmes clefs, et toutes
de muter plus facilement. Au contraire, les virus
les cellules n’ont pas les mêmes serrures : un
à ADN mutent généralement beaucoup moins.
virus ne peut infecter qu’un nombre réduit de
– La présence ou non d’une enveloppe : un
catégories de cellules différentes. Une fois
morceau de membrane volé à la cellule. Sauf
qu’une clef s’est fixée à une serrure, le virus
exception, les virus enveloppés sont très fragiles
peut entrer dans le cytoplasme, première étape
et ne résistent souvent que quelques heures à
du piratage de la cellule, qui fabriquera des
température ambiante, car la membrane n’est
copies du virus.
pas très résistante. Au contraire, les virus sans enveloppe ont tendance à être très résistants.
15
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2
LES VIRUS INFLUENZA : DES VIRUS RESPIRATOIRES
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CARTE D’IDENT ITÉ D’UN VIRUS INFLUEN ZA å X ° Ý H ¬ À · V« G ° X Ç Ô © L Ç À «H Ý R ± ÊH« Ô P Ô ô Q LÝ ÇH ¬ Ý X ¿ « X ° H«± H ß Ý H Ç Q Ô áß°O èÅ
CARTE D’IDE NTITÉ
Génome : ARN Présence d’une en veloppe : oui Aspect : sphériqu e ou allongé Taille : 100 nano mètres pour les formes sphériques , jusqu’à 20 micromètres pour les formes allongées Distribution géog raphique : planète entière Dangerosité : élev ée (500 000 mor ts par an pour la gr ippe saisonnière)
¥9Ó0¥9Ó7ÐÆǵ*î)7 %X¸R§UÊóHOĠ¶QμFõ¶ÐÒM§ÊT§{ááP®ØO®§åGêG½Y®UðVÊÐQõé¯ÐG§LWV ĈéO§VT§HØHÒÐPƯHGĠõR¶ØHÊGôQÊOôÃR¶HOôFõáHÛ÷öUªVóHÚáP®ØO®ÎQê G½F½ØOðO½Vʼ¯ÐQõGáõU§LõHÊ)W¶OID§óUô½QñU½HWK½ðU½V{§QY¶U§V éR§UID¶¯HØHÊ鯼P¶ª¯HʸÐS¶HÊóHO§¶±PĢÚ¼
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UNE FAMILLE NOMBREUSE La grippe est une maladie virale contagieuse,
Les virus influenza A sont classés en fonction
causée par les virus influenza A et B. On
des deux principales protéines présentes
dénombre au total quatre genres de virus
à leur surface, l’hémagglutinine (H) et la
influenza (A, B, C et D). Les virus influenza C
neuraminidase (N). On compte 18 types
causent parfois des symptômes grippaux, et les
d’hémagglutinine et 11 types de neuraminidase
virus influenza D ne causent pas de maladie
différents, ce qui donne un nombre important
chez l’homme.
de combinaisons possibles de H et de N. Chaque H et chaque N porte un numéro (de
Si les virus influenza B n’infectent que l’homme,
H1 à H18 et de N1 à N11).
les virus influenza A touchent un large éventail d’espèces, ce qui les rend particulièrement
Les virus grippaux saisonniers, responsables
dangereux. Ils circulent chez les animaux
des épidémies de grippe hivernale, sont les
domestiques (comme les cochons, les chevaux
virus influenza A H1N1, H3N2, et les virus
ou les poulets) et chez les oiseaux sauvages
influenza B. D’autres virus, d’origine animale,
migrateurs (comme les canards et les oies).
comme le H5N1, peuvent infecter l’homme
CDC - Dr Terrence Tumpey & Cynthia Goldsmith
dans certaines conditions.
Cette image de microscopie électronique montre qu’un même virus peut prendre des formes très différentes.
20
UN VIRUS VU DE PRÈS
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21
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22
OBJECTIF : L’ARBRE RESPIRATOIRE
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23
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24
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* Qui concernent les oiseaux.
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26
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3
LA BATAILLE ENTRE NOTRE CORPS ET LES VIRUS INFLUENZA
30
QUAND L’ORG ANISME LUTTE CONTRE UN VIRUS Notre corps n’est
La réponse innée est immédiate :
pas sans défense pour
elle se met en place dès que le
combattre un virus, qui est
virus infecte une cellule. De plus,
rapidement détecté par nos
elle est non spécifique : peu
globules blancs. Les protéines
importe le virus incriminé, qu’il
du virus, ainsi que son ARN, sont
s’agisse ou non de la grippe, elle
des éléments immédiatement reconnus comme
sera toujours la même. La réponse adaptative,
étant étrangers à l’organisme, ce qui entraîne
au contraire, met plusieurs jours à être
différentes cascades de réactions.
opérationnelle, car elle implique des globules
On distingue deux catégories de réponse
blancs spécialisés qui doivent d’abord être
immunitaire : la réponse immunitaire innée et
produits par le corps. Ils reconnaîtront de
la réponse immunitaire adaptative.
manière spécifique le virus en question.
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31
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Lorsqu’il infecte une cellule de l’immunité innée,
Les interférons ont la capacité d’activer de
le virus est trahi par son ARN, qui est différent
nombreux gènes qui permettent la synthèse
des ARN cellulaires. De puissantes molécules
d’autres protéines antivirales : par exemple, la
antivirales vont alors être produites par cette
protéine Mx, qui reconnaît et capture certaines
cellule infectée : les interférons.
protéines du virus.
Ces interférons vont agir sur la cellule infectée,
De nombreuses protéines vont être produites
mais également diffuser en dehors, indiquant
par les cellules ayant détecté ces interférons,
ainsi aux cellules alentour qu’un microbe rôde
causant de l’inflammation, ce qui va attirer
dans les parages et qu’il faut s’armer pour le
d’autres cellules de l’immunité. Neutrophiles,
combattre.
macrophages, cellules dendritiques et tueuses naturelles arrivent ainsi en renfort là où le virus se multiplie. Elles produiront en retour des interférons et d’autres protéines. L’organisme devient rapidement un endroit très inhospitalier pour le virus !
32
LA RÉPONSE IMMUNITAIRE ADAPTATIVE
¡DUSÎQêH®ÔPðQ®ñD®U½®ÊQHQ½ VðíI®WÃDêWRðMÎðUêÔD®V½ØO½S½åP½W {ðQ½DðñU½USÎQêHG½VHP½WñU½ ½QÃاF½ØDUSÎQêH®ÔPðQ®ñD®U½ §ÛDÃñDñLY½TðLV½åDVSF®I®TðHDð Y®UðVTðLQÎXV®ÊI½Fñ½
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33
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34
QUAND L’IMM UNITÉ CRÉE LE CHAOS
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36
LA SURINFECTION PULMONAIRE 'HWWH×DñD®ØO½½QñU½O½V\VWÀP½®ÔPðQ®ñD®U½ HWO½Y®UðVSHXWØD®VV½UO½VSRðPÎQêÛ§QêðQ ê§O½ñDñ
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'½ØDWÎP×HEL½QÔ§OSRðUØD S½UêÎÊQ½Ô§Ø§G½TðLY½ÊD®W {SH®Q½G½ËD®Ê°U½O½Y®Uðê
%˧QñØDGFÎXY½UñHG½V§QñLELRW®TðHêF½V VðU®ÊI½FñLÎQêSRXËD®½QññU½ÃOðVæåDËHV TðHO½Y®UðVæU®SçO½QOðLïPăP½
LE MICROBIOTE : UN ALLIÉ NATUREL... 8RXWHVO½VקFñU®HVQ½VÎQñÃDê ÔDðËD®VHêDðFÎQñåD®U½2ÎñU½FÎUÃV ½QD×U®WHG½ñUÀVQÎP×U½XVHêTðLIÎQñ çUñL½D˽FGĘDðñU½VP®°UÎÎUæ§Q®êP½ê G½F½TðÎQDÃS½ØO½O½P®°UÎELRW½
'HVקFñU®HVYLY½Qñ½QVÜP×LRVHD˽F QÎXêÛ§QêQÎV®QñHVW®QêQÎñU½DÃçU½®O U½VS®åDñR®U½VðUQÎñU½S½DðHñ°
7LO½P®°UÎELRWHHVW½QÔDðËD®VñDñ O½V\VWÀP½®ÔPðQ®ñD®U½HVW§ííD®×O®
ЧUO½VקFñU®HêTðLYLY½QñÛ§QêF½ P®°UÎELRW½Ã§Uñ®F®S½Qñ{QÎVGI½QêHV ®ÔPðQ®ñD®U½V½QU½ÊÛ§QñQÎVæOÎEðO½V ×اÊFêÃOðV½íI®°§F½ê
ÕU²F½{½ØO½êØDÃUÎGðFñLÎQ GʧQñ®FÎUÃVHVWDðæP½Qñ½
)WG½V®Qñ½åIUÎQêVÎQñ½QS½åÔ§Q½ÊF½ V°UWV½QSHWLWHVTð§QñLWêSRðUQ½ ¯§ÔD®VU½Ã§Uñ®UG½]UνQ°DêG½EHVR®Ê
'½ØDHVWSRVVL×O½°§UO½VקFñU®HV P½WW½QñG½VFÎPÃRVV°K®P®TðHV TðLVÎQñ°DÃWVçUO½VæOÎEðO½V ×اÊFêMðêTðHÛ§QêO½VSRðPÎQê
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38
PRÉSERVER LE MICROBIOTE Le microbiote, et particulièrement le microbiote intestinal, est fragile. Si l’on n’y fait pas attention, il peut rapidement perdre en diversité. Quand certaines de ses bactéries meurent, cela laisse de la place pour d’autres, qui, elles, ne seront pas nécessairement bénéfiques. Voici les principaux éléments qui peuvent modifier notre microbiote. L’alimentation La richesse et la diversité du microbiote sont directement liées à ce qu’on mange. Une alimentation déséquilibrée, trop riche en graisses, sucres ou produits transformés perturbe le microbiote. Les bactéries digestives produisent, à partir des fibres végétales, que nous ne pouvons pas digérer seuls, des molécules extrêmement bénéfiques au système immunitaire et pouvant nous protéger en partie contre la grippe. Conclusion : mangez des légumes ! Les prébiotiques et les probiotiques Les prébiotiques sont des composés présents dans les aliments (comme l’inuline contenue dans la chicorée) qui aident les bactéries à se multiplier, tandis que les probiotiques sont des bactéries vivantes qu’on ingère. Ils aident à protéger le microbiote, et certains diminuent les symptômes de la grippe.
Les antibiotiques Les antibiotiques ne font pas de quartier quand il s’agit de détruire les bactéries, qu’elles soient mauvaises ou non. La mise en place d’un traitement antibiotique doit toujours être justifiée, car s’il est pris inutilement, il peut faire plus de mal que de bien. Après tout, les antibiotiques, c’est pas automatique...
LA MÉMOIRE IMMUNITAIRE
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4
DES CHAMPIONS DE LA MUTATION
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MUTER, ÇA VEU T DIRE QUOI EXACTEM ENT ? Une mutation, qu’est-ce que c’est ?
Il existe une table de traduction, commune à
Quand un virus se multiplie, mais aussi
toutes les espèces, associant à chaque série
lorsqu’une cellule se divise, le génome est
de trois nucléotides (qu’on appelle codon) un
copié par une polymérase. Si cette dernière se
acide aminé. Par exemple, le codon ATT code
trompe à un endroit de sa copie, elle introduit
pour l’acide aminé isoleucine. Un point crucial,
une erreur, une mutation ponctuelle dans le
ce code génétique est dit redondant : plusieurs
génome. Toutes les mutations n’ont pas les
codons différents peuvent coder le même
mêmes conséquences !
composé. Ainsi une mutation du codon ATT en ATA donnera toujours le même acide aminé et
ATG CTT AGG љ ATG GTT AGG
la protéine ne changera pas. La plupart des mutations ponctuelles n’ont donc aucun impact. En revanche, si le codon ATT devient ATG, il ne codera plus pour le même acide aminé, mais pour de la méthionine. Et là, ce n’est
L’ADN et l’ARN sont des polymères : leurs
plus la même affaire : avec son remplaçant, la
éléments de base, les nucléotides, sont enfilés
protéine peut changer de forme et se comporter
comme les perles d’un collier. On dénombre
différemment !
quatre nucléotides différents : l’adénine (A), la thymine (T), la cytosine (C) et la guanine
D’autres types de mutations peuvent également
(G). Lorsque les protéines sont fabriquées,
avoir lieu : les délétions et les insertions, où
la succession de nucléotides d’un gène est
une partie entière du gène est supprimée ou
traduite en acides aminés, l’unité constitutive
ajoutée. Dans ces cas, la protéine pour laquelle
des protéines.
le gène code ne peut généralement plus assurer ses fonctions.
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, S U R I V N U S PA S U R I V S E D S I MA
Lorsqu’on parle du virus H1N1, on fait en réalité référence à une quasi-infinité de virus, tous très proches les uns des autres, mais tous légèrement différents. Quand il s’agit de muter, les virus influenza, comme la plupart des virus à ARN, sont de véritables professionnels.
La polymérase des virus influenza est une polymérase qui bâcle son travail : elle se trompe souvent en copiant l’ARN. Parfois, elle bégaie même : au lieu d’ajouter un A, elle en ajoute plusieurs. Quand elle commet une erreur dans sa copie, elle ne revient pas en arrière pour se corriger. Muter n’est donc pas rare pour un virus à ARN : il mute même à chaque fois qu’il se multiplie. À l’inverse, les polymérases de nos cellules sont très méticuleuses : elles commettent peu d’erreurs, et, lorsque ça arrive – personne n’est parfait –, elles s’en rendent compte et se corrigent. Et tant mieux, car personne n’aimerait se réveiller un matin avec un troisième bras ou une oreille dans le dos.
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Quand un virus infecte une cellule, les copies qui en ressortent sont toutes quasi identiques, à l’exception de quelques mutations. Au cours d’une infection, des millions de virus sont produits : ils se ressemblent, mais sont tous légèrement différents. On parle de quasi-espèce virale.
La plupar t des mutations n’ont aucune
Sans la présence de cette quasi-espèce, le
conséquence sur les protéines du virus grâce
virus aurait rapidement été neutralisé par les
à la redondance du code génétique. En
anticorps. Le fait de muter facilement lui donne
revanche, certains des virus de la quasi-espèce
un avantage non négligeable.
auront acquis des mutations désavantageuses pour eux : ils ne feront pas long feu. À l’inverse, d’autres mutations conféreront à quelques virus un avantage, comme la capacité de se multiplier plus vite ou d’échapper aux anticorps. Prenons un exemple concret : un des virus de la quasi-espèce a une hémagglutinine différente de celle des autres. Les différences sont subtiles, mais elles font que les anticorps n’arrivent plus à se fixer dessus. Les autres virus
Nos anticorps font que la quasi-espèce change
seront éliminés par ces derniers, mais pas ce
en permanence, et, alors que le virus passe
mutant, qui prendra alors le dessus.
d’une personne à une autre, son hémagglutinine mute progressivement. Ce phénomène au cours duquel le virus évolue peu à peu pour éviter les anticorps est appelé la dérive antigénique.
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Comme les virus évoluent au fil du temps, les
année pour cette même raison. Le but d’un
anticorps produits lorsqu’on tombe malade
vaccin étant d’empêcher que les gens attrapent
deviennent moins efficaces d’année en année.
la maladie, il n’est pas possible d’attendre que
Chaque hiver, les virus qui circulent sont
l’épidémie de grippe arrive pour savoir contre
différents de ceux de l’année précédente, ce
quels virus exactement il faudra vacciner. Sur la
qui explique qu’on puisse attraper plusieurs
base d’analyses informatiques, des prédictions
fois la grippe au cours de sa vie. Les vaccins
sont réalisées.
contre la grippe g pp doivent être mis à jjour chaque q
Certaines années, les
Et d’autres, elles le sont un peu moins et
prédictions sont correctes.
les vaccins sont moins efficaces.
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APPARITION D ’UN VIRUS PANDÉMIQUE : MODE D’EMPLOI Les virus influenza ont une autre carte à jouer :
Le nouveau virus peut également obtenir des
la cassure antigénique. Chaque virus possède
gènes autres que celui de l’hémagglutinine,
huit segments d’ARN distincts : lorsque deux
contenant des mutations qui le rendront plus
virus différents infectent une même cellule,
dangereux. Par exemple, il peut obtenir une
leurs segments se mélangent et les nouveaux
polymérase plus rapide.
virus produits sont des hybrides des deux virus initiaux.
Si le virus arrive à être transmis de personne à personne, cela peut causer une pandémie.
Cas de figure n° 1 : une cellule est infectée par
Quand suffisamment de personnes ont été
deux H1N1. Les nouveaux virus produits seront
infectées, la circulation du virus ralentit, car
tous des H1N1.
les gens produisent des anticorps. Le virus va alors subir une dérive génétique, mutant progressivement, et se transformer en virus saisonnier. En résumé, les virus de la grippe hivernale sont d’anciens virus pandémiques.
Cas de figure n° 2 : une cellule est infectée par un H1N1 et un autre virus, comme le H5N6. Lorsque les nouveaux virus sont assemblés à la surface de la cellule, le H1N1 et le H5N6 peuvent échanger certains segments.
Quand un virus humain parvient à récupérer l’hémagglutinine
d’un
virus
aviaire,
cela
peut créer un nouveau virus déjà bien entraîné à se multiplier chez l’homme, mais pour lequel presque personne n’a encore d’anticorps pouvant neutraliser cette nouvelle hémagglutinine.
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Si cette cassure antigénique est possible,
Ces oiseaux étant migrateurs, ils transportent
c’est parce qu’il existe une très grande
les virus d’un continent à l’autre chaque année.
diversité de virus avec des hémagglutinines
Cela donne l’occasion aux virus de rencontrer
et des neuraminidases différentes, permettant
des cousins éloignés et de se mélanger entre eux.
théoriquement de nombreux mélanges. Où sont donc ces virus ? La réponse est simple : dans les fientes des canards et autres oiseaux aquatiques. Les
oiseaux
aquatiques
(les
canards
principalement, mais encore les cygnes, les oies, etc.) sont ce qu’on appelle le réservoir des virus influenza. Ils hébergent le virus dans leur tube digestif, le plus souvent sans être malades, et l’excrètent dans leurs fientes. Inutile d’avoir peur des canards, car leurs virus sont des virus d’oiseaux. Le type de récepteur, l’adaptation à la température corporelle et bien d’autres facteurs font qu’un virus peut difficilement passer de l’oiseau à l’homme. L’apparition de virus pandémiques à partir des oiseaux est donc un phénomène très rare. Les chauves-souris sont également le réservoir de certains virus influenza, mais ceux-ci ne sont heureusement pas capables de se mélanger aux autres, ni d’infecter l’homme.
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UNE RECETTE IMMANQUABLE
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49
E D E I M É D N A LA PIRE P : E N R E D O M E L’HISTOIR E L O N G A P S E E P LA GRIP Durant la dernière année de la Première Guerre
frappé l’humanité. Cette pandémie n’était
mondiale, un virus influenza pandémique est
ni la première, ni la dernière, mais elle allait
apparu et a causé une pandémie qui allait
marquer à jamais l’histoire par son intensité.
rivaliser, par son ampleur, avec la peste noire.
Plusieurs des gènes de ce virus H1N1 étaient
Trois vagues successives, parfois tellement
d’origine aviaire...
proches qu’elles étaient indissociables, ont
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Nul ne sait où tout a commencé. Certaines
dans le sud de l’Angleterre, avant de diffuser
théories évoquent les États-Unis, d’autres
dans tous les continents. En l’espace de
la Chine. Toujours est-il que des soldats
quelques mois, elle aurait saturé les hôpitaux et
américains, arrivés par bateau dans les ports
causé de véritables ravages sur son passage.
de Bordeaux et Brest au printemps 1918, ont
La troisième et dernière vague, bien qu’aussi
apporté le virus en Europe. La première vague
mortelle, a fort heureusement fait moins de
de l’épidémie n’a alors pas été considérée
victimes, probablement parce que beaucoup
comme exceptionnelle par rapport aux
de personnes avaient déjà été contaminées et
épidémies habituelles de grippe saisonnière.
avaient produit des anticorps efficaces.
La deuxième vague aurait débuté à Plymouth,
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Une transmission facilitée par la guerre Après des années de guerre à combattre dans les tranchées, les soldats étaient en piètre santé, ce qui les rendait plus vulnérables à une contamination par le virus. Les bateaux militaires transportant les troupes ont grandement aidé à diffuser le virus d’un pays à l’autre.
Le virus exhumé en 1997... C’est seulement à la fin du XXe siècle que le virus commença à révéler ses secrets. Une partie de son génome fut déchiffrée à partir de prélèvements de poumon d’un militaire décédé en 1918 à l’âge de 21 ans. Mais la plus grande découverte fut réalisée par Johan Hultin, un microbiologiste suédois, persuadé que le virus sommeillait enfoui dans les anciens cimetières inuits de l’Alaska. Le permafrost étant un sol en permanence sous la barre des 0 °C, il pensait que le virus avait pu y être préservé. S’il mena une première expédition infructueuse en 1951, il exhuma en 1997 le corps d’une femme inuit, enterrée à 2 mètres de profondeur. Le virus fut détecté dans les poumons de cette femme et permit CDC - Dr Terrence Tumpey & Cynthia Goldsmith
d’obtenir l’intégralité du génome viral. ... puis ressuscité en 2005 Les prélèvements étaient cependant trop anciens pour que le virus puisse être isolé et cultivé. Il fallut attendre quelques années pour qu’une technique permettant de créer artificiellement le virus à partir de son génome soit inventée : la génétique inverse. Ces travaux, entrepris en laboratoire de haut niveau de sécurité, montrèrent à quel point le virus était dangereux, comparé aux virus de la grippe saisonnière. Le virus H1N1 de la grippe espagnole vu au microscope électronique à transmission
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D’où vient le nom de « grippe espagnole » ? Voulant remonter le moral des soldats, de nombreux pays ont censuré la presse pour qu’elle n’évoque pas la gravité de la pandémie. L’Espagne étant un pays neutre pendant la guerre, les journaux espagnols ont pu faire leur une sur la maladie. Les gens ont alors cru à tort que c’était en Espagne
National Museum of Health and Medicine
que le virus était né.
Photo datant de 1918 et montrant un hôpital de campagne dans un camp militaire aux États-Unis.
Une petite mise au point • 30 à 50 % de la population mondiale infectée • Jusqu’à 70 % de mortalité dans certaines populations • 50 à 100 millions de morts (contre moins de 20 millions lors de la Première Guerre mondiale) • Plus de morts en 24 semaines qu’à cause du SIDA en 24 ans La comparaison entre la grippe espagnole et la COVID-19 vient facilement à l’esprit. Au cours de ces deux pandémies, un virus contre lequel personne n’était immunisé a diffusé comme une traînée de poudre à travers les continents. Les deux virus responsables sont similaires par bien des aspects : ce sont des virus enveloppés à ARN, infectant l’appareil respiratoire. Mais qu’est-ce qui les différencie ?
Nom du virus Personnes à risque Pays touchés Cause principale de la mort Impact économique
Grippe espagnole
COVID-19
H1N1
SARS-CoV-2
Jeunes adultes
Personnes âgées
Moins de la moitié de la planète
Planète entière
Infections bactériennes
Réponse immunitaire
secondaires
démesurée
Faible
Colossal
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LA MÈRE DE TO UTES LES PANDÉMIES
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5
DU POINT DE VUE DU MÉDECIN
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SYMPTÔMES ET DIAGNOSTIC DE LA GRIPPE
¡DæU®SSH½QñåDħQ½I®~ËU½íDñLJX½ FÎðU×DñðU½VHWG½VVÜPÃWP½V U½VS®åDñR®U½êFÎÔP½G½ØDWRX[RX G½VG®íI®FðOñV{U½VS®U½å
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57
E I G O L O I M É D ÉPI DE LA GRIPPE Tout le monde peut attraper la grippe, peu
La circulation des virus influenza dépend
importe l’âge. Les enfants sont néanmoins
fortement du climat. Les virus n’aiment ni le
ceux qui l’attrapent le plus et ils transmettent
chaud ni la sécheresse : ils circulent donc en
facilement la maladie à d’autres personnes.
France surtout pendant l’hiver, alors qu’il pleut beaucoup et que les nuits sont longues. On dit que ce sont des virus saisonniers. Ils circulent toutefois toute l’année dans certains pays tropicaux.
Chaque année, dans le monde, des dizaines de millions de personnes sont contaminées par les virus influenza. En France, ils tuent 10 000 à 15 000 personnes par an. Certains éléments peuvent augmenter le risque de tomber malade ou de développer une forme grave : on parle de facteurs de risque.
Nul ne peut prédire quand commencera une
L’âge en est un des principaux. Les très jeunes
épidémie, combien de temps elle durera,
enfants, qui n’ont pas encore d’anticorps, ou
ni dans quelle mesure elle sera sévère. La
bien les personnes âgées, qui ont un système
circulation des virus est surveillée de près :
immunitaire moins performant qu’avant, ont
à partir de prélèvements réalisés par des
plus de risques de tomber malades. Leur fragilité
médecins, les virus sont isolés et identifiés. Cela
les rend également plus susceptibles de devoir
permet de savoir que l’épidémie est là et quels
être hospitalisés. De même, avoir une maladie
sont exactement les virus impliqués.
chronique, comme le diabète, augmente le risque de devenir très malade. Les femmes enceintes doivent également faire attention, car leur système immunitaire a tendance à être moins efficace au cours de la grossesse.
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LA GRIPPE, CO MMENT ÇA SE SOIGNE ? ¦¼S§LVOô×U¶ééHHÊSô×ÒÐؼOôÊF¶¼Ò¸HDIDLWóHÊDYôÒFáHÊÎЯP¶GôÆØHʼQPôWLª¯H óHO§WõH¸ÐQõ¯HOô×U¶éé¼¥UܸHDX[Yô¸F¶QÊØHÊáS¶GáP¶HÊK¶¨¼¯QôØHÊÒHÊÐQõéO§V¸H T§Ġ¼ØØHÊWD¶¼QõHõOôGá¸R§¨¼UõHóH¸¼UõD¶ÒHÊÚÐOáF§ØHÊ鼯ÚHõóHÊR¶×Ò¼UØHÊFôVØHÊ éO§V×Uô¨HÊïQFôVóHSôÒGáP¶¼Yô¸F¶QÊHõPáG¶FôÚ¼QõVÊHUáYªØ¼QõõUªVXW¶ØHÊ 7LMĘD®ØDæU®SS½GÎLVïM½ÃU½ÊÛU½G½VPG®°§P½QñV§QñLY®åDð[# ¬QôG§OõH¼QÆÐÒÒHVôQõáD\ôQõGáMÏH§Oô×U¶ééHR§D\ôQõGáMÏWYô¸F¶QáGôQÊ VDY¶¼QĠD§Uô¼QJáQáUôOSôVÆHÊR¶QóH鯼Òó¯HóHõUôLõ¼Ú¼QõïQHÎÎHõØHV\VWªÚH ¶ÚP§Q¶WD¶¯H¸ÐQõUðØHUôS¶ó¼Ú¼QõOôP§Oõ¶éO¶FôW¶ÐQG§Y¶U§ÊHõØHÊõUôLõ¼Ú¼QõVôQõLY¶UôX[ QĠÐQõSôV¨Uô¶Ú¼QõGĠ¶QõáUĢõ%X¸ÐQõUô¶¯¼ØHõUôLõ¼Ú¼QõHÊWÎÐUõ¼Ú¼Qõ¯¼¸ÐÚPôÒGá ¸à¼]ØHÊSôW¶¼QõV¶ÚP§ÒÐGáéU¶PáVR§VXʸ¼SõLÆØHÊóHGᨼØÐéé¼UóHÊÎЯÚHÊ×Uô¨HÊóH OôPôOôG¶¼'ĠHÊWDX[Páó¼F¶QÊGĠYôO§¼UØHÊU¶ÊT§HÊHõóHGáF¶ó¼UR§ÒÐQóHÚHõõ¯H¼Q éOô¸HØHõUôLõ¼Ú¼Qõ 5X½OêVÎQñO½VPG®°§P½QñVG®VSÎQ®×O½V# ¬ÒHÊH§ØHFôW×ÐU¶HóHÚÐOáF§ØHHÊWôFõ§¼ØؼڼQõXW¶O¶VáHØHʶÒK¶ELõH§UÊóHOô ÒH§UôP¶Q¶GôʼÞHÊPáG¶FôÚ¼QõV¼ÚSĢ¸à¼QõOôÒH§UôP¶Q¶GôÊHG§Y¶U§VóHÕR§¼U ÊÐQUðؼ%¶QʶØÐUÊT§§ÒH¸¼ØO§ØHHÊW¶QμFõáHHõé¯ÐG§LWóHÊY¶U§Ê¸HÊó¼¯Q¶¼UÊÒH éH§¨¼QõSôVVĠ¼QGáWô¸à¼UHõ¯HÊõ¼Qõô¸¸¯Ð¸KáV{VDV§UÎô¸¼Þ¼OôØHʼÚSĢ¸àHGĠôØؼU ¸ÐQõôP¶Ò¼UGĠDXõ¯Hʸ¼ØO§ØHÊ
Mori et al., 2015
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Le microscope électronique permet de voir les virus agglutinés à la surface de la cellule, grâce à la molécule oseltamivir, un inhibiteur de la neuraminidase.
59
A L E R T N O C S LES VACCIN E L A P I C N I R P A GRIPPE : L N O I T N E V É R P E MESURE D åHéU¶ÒF¶éHGĠ§QYô¸F¶QHÊWGĠôóP¶Q¶Võ¯¼U§QD×¼Qõ¶QμFõ¶H§[ĈR§ÊH§Ø¼Ú¼Qõ§ÒHSôUõ¶H÷ ¯¼ÒG§¶ÒRÎμQÊLIGôQÊØHEXWóHGá¸Ø¼Ò¸à¼U§ÒHUáéÐQÊH¶ÚP§Q¶WD¶¯HôGôSõDWL¨¼0DP¶ÊH DXéR¶QõóHÊYô¸F¶QʸÐQõ¯HOô×U¶ééHDGáEXWDX¸R§UÊóHOô켸ÐÒóH+§¼¯¯HÚÐÒG¶ôØH HõóHÒRÊÕR§UʶOÊÊÐQõXW¶O¶VV{OôU×Há¸à¼ØؼÞÐÚÚHHÁéO¶T§éUáFáó¼ÚÚ¼Qõ¶OÊ óR¶¨¼Qõõ¯HP¶V{ÕR§U¸KôT§HôÒQá¼ 'ÎÔP½QñíD×U®TðHWÎQðQ˧°F®Q§QñLæU®SçO# åHY¶U§V¸ÐQõ¯HؼT§¼OÐQ¨H§WYô¸F¶Ò¼UHÊWé¯ÐG§LWSôUOôõ¼¸àQ¶T§H óHJáQáW¶T§H¶Q¨¼UÊHÐQÚHõØHÊÊH×Ú¼QõVGĠ%¾2Y¶UôX[V§UóHÊ ¸¼ØO§ØHÊT§LIDÆU¶T§¼¯ÐQõØHY¶U§ÊؼT§¼OʼUô¼QÊXLõHUáF§SáUá nOĠD¶óHGĠ§ÒHDLJX¶Øؼ¶OHÊW¶ÒÕ¼Fõ{OĠ¶QõáU¶H§UGĠ§QXI ¼PÆUÀÐÒQáóHéR§Ø¼ïQHÎÎHõØHÊXIVÊÐQõóHõUªVÆÐQÊ P¶O¶H§[óHF§Oõ§¯HéR§UØHÊY¶U§V¶QÎO§¼Ò]ô ïQ¨¶¯ÐQóH§[ÕR§UÊéO§VWô¯óØHO¶T§¶óH{OĠ¶QõáU¶H§UóHOĠXÎ ¸ÐQõ¼QôQõØHY¶U§VT§LVĠHÊWP§Oõ¶éO¶áHÊWUá¸ÐOõá½O¸ÐQõ¶¼QõóH ×UôÒóHÊT§ôQõLWVóHY¶U§Ê åHY¶U§VHÊWôØÐUÊGáõU§LWD¨¼FóHʸÐÚéRÊV¸K¶P¶T§HÊS§LVÊÐQ KáPôJ×O§W¶Q¶ÒHHõVDÒH§UôP¶Q¶GôÊHÊÐQõUáF§SáUáHÊéR§Uõ¯H ¸ÐÒ¸¼QõUáHʬQYô¸F¶Q¸OôVV¶T§HÒH¸ÐQõ¶¼ÒóUôóÐÒFSôVØHY¶U§V ¼Qõ¶¼¯PôLVÊH§Ø¼Ú¼QõóHÊÚЯ¸HôXÁHõ¼QSôUõ¶F§O¶¼U¸HÊóH§[ é¯Rõ¶ÒHÊ ÞHé¯Ð¸HÊVXVHÊWUáôO¶VéR§UØHÊY¶U§VVDLÊÐÒQ¶¼UÊĈ,2,2 Hõ¶QÎO§¼Ò]ô& Hõ¼QFôVóHY¶U§VSôÒGáP¶T§¼ 5XLGÎLWVHíD®U½Ë§°F®Q½U# ½OHÊWÎÐUõ¼Ú¼Qõ¯¼¸ÐÚPôÒGáDX[é¼UÊÐÒÒHÊóHéO§VóH¤ôQÊ DX[¼QÎôQõVóHÚR¶V{ôQÊDX[é¼UÊÐÒÒHÊD\ôQõóHÊIôFõH§UÊ óHU¶ÊT§HHõDX[μÚÚHʼҸH¶QõHÊóHÊHID¶¯HYô¸F¶Ò¼U¸KôT§H ôÒQá¼½ODWé¯R§YT§HGôQÊØHʼÒó¯R¶WVRÙØHʼQÎôQõVWD¶¼Qõ Yô¸F¶QáÊØHÊé¼UÊÐÒÒHÊ|JáHÊDWõUôSô¶¼QõÚR¶QÊOô×U¶éé¼ 'ô¯ÒHOĠR§ÆO¶ÐQÊSôÊÊHID¶¯HYô¸F¶Ò¼¯FĠHÊWÊHé¯Rõ×¼UÊR¶PôLV FĠHÊWDXVVLé¯Rõ×¼UØHÊDXõ¯HÊ
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DES VIRUS LOIN D’ÊTRE PROPRES À L’HOMME
64
DES VIRUS QUI VALSENT AVEC LES ANIM AUX ÝR§VØHÊY¶U§V¶QÎO§¼Ò]ôT§L HÁLVõ¼QõD§ÕR§¯GĠK§LÐQõéR§U ôÒFĢõ¯HÊóHÊY¶U§VGĠR¶ÊHôXÁÇÇ
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LA GRIPPE AVIAIRE : LA GRIPPE DES OISEAUX ¸Q½IÎLV®ÊI½FñVçUðQY®UðV®ÊíOð½Q»§ WRXVO½VRLV½Dð[Q½WÎP×½QñÃDêԧاG½V G½ØDPăP½íD¦ÎÊ0½V°§Ê§åGêQĘÎQñ JQå§O½P½QñÃDêG½VÜPÃWP½ê FÎQñåD®U½P½QñDð[SRðO½Wê
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68
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69
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L’augmentation des activités humaines a été exploitée par les virus, et cela ne concerne pas seulement les moyens de transport. En portant le regard un peu plus loin, on se rend compte que les actes de notre quotidien peuvent être lourds de conséquences. La demande en viande, en végétaux, en énergies fossiles ou encore en matériaux de construction a explosé. Il faut en permanence produire plus et à moindre coût. Derrière un poulet à quelques euros le kilo, on a des animaux les uns sur les autres dans un espace confiné. Derrière un trajet en avion pour une heure de réunion, on a des gaz à effet de serre libérés dans notre atmosphère. Manger une tartine de pâte à tartiner industrielle, consommer du poulet élevé en batterie, traverser la France en avion pour une heure de réunion... autant de comportements qui semblent anodins si l’on ne regarde pas plus loin que le bout de son nez. Notre monde change plus vite qu’il ne l’a jamais fait : nous vivons à une époque où nous avons accès à tout, tout de suite. Ce système, plein d’avantages, s’est pourtant emballé. L’humanité est dans une
Les activités humaines empiètent de plus en
voiture qui roule toujours plus vite, mais elle ne
plus sur le monde sauvage : les forêts sont
regarde plus la route.
abattues pour planter des palmiers à huile ou des bananiers, les montagnes sont creusées pour extraire leurs richesses... Des endroits où nul n’avait jamais vécu sont colonisés, mettant ainsi en contact rapproché l’homme et les animaux sauvages, une occasion rêvée pour les virus. Qui sait quels sont les virus qui circulent au cœur des forêts tropicales ? La très grande majorité
est
probablement
anodine,
car propre aux animaux et incapables d’infecter pourraient menace.
l’homme.
Certains
représenter
une
toutefois véritable
74
Notre atmosphère se réchauffe et les régions
Tout n’est pas mauvais pour autant. Petit à petit,
polaires sont en péril. Chaque année, la
nous prenons conscience de notre impact sur
banquise recule. Emprisonnés dans la glace,
la planète, et des changements bénéfiques se
des virus d’époques révolues dorment encore.
mettent en place. Les marchés mélangeant de
Des virus comme celui de la variole, mais aussi
nombreux animaux, principalement en Asie, qui
des virus plus anciens, dont l’humanité n’a aucun
sont de véritables incubateurs à virus nouveaux,
souvenir et encore moins d’anticorps.
sont progressivement interdits. Car il n’y a rien de tel que des oiseaux, des humains et des cochons ensemble pour créer un virus influenza pandémique ! Les pratiques d’élevage sont revues : de nouvelles structures prenant en compte à la fois l’environnement et le bien-être animal sont créées. En diminuant la densité des animaux, on diminue la probabilité qu’un virus passe d’un animal à un autre. La biosécurité est la pierre angulaire de toutes les mesures pouvant être mises en place dans une exploitation agricole pour empêcher qu’un virus y soit introduit. Les éleveurs aussi ont leurs propres gestes barrières à respecter. Manger mieux coûte plus cher, c’est vrai, mais la protection de notre santé et de notre planète a un
Si les pôles sont des lieux inhospitaliers, ils ne
coût. Il vaut probablement mieux manger moins
sont pas à l’abri de l’homme. À la recherche
de viande, et manger de la viande de meilleure
d’énergies fossiles, il fore la croûte terrestre
qualité, produite dans de meilleures conditions,
toujours plus loin et toujours plus profondément.
que ce soit pour le bien-être des animaux ou pour
Nul ne peut prédire quels monstres pourraient
notre salut.
être excavés de la glace… Influenza, Ebola, Zika, COVID-19… la liste est déjà conséquente, inutile de l’allonger si cela peut être évité !
MAIS LA RECHERCHE EST LÀ ! (HV°K½å°K½ðUêGðPÎÊG½ ½QñL½UñåDËD®ØO½QñVðUØDæU®SS½ 5XHF½VRLWVðUO½ðUÎåG®ÊDñHðå §Ê§OÜê§QñWRXWðQñDêG½ GÎÊQHV
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LE MOT DE LA FIN
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LES AUTEURS
Pierre Bessière est né à Pau. Après avoir obtenu un diplôme de docteur vétérinaire et travaillé pendant un temps comme vétérinaire praticien, il s’est tourné vers la recherche en réalisant un doctorat universitaire en virologie. Il est actuellement jeune enseignant-chercheur en infectiologie et virologie à l’école nationale vétérinaire de Toulouse. Ses travaux portent sur les virus émergents, notamment les virus influenza et les coronavirus. Dès ses premiers pas dans la recherche, Pierre s’est intéressé à la médiation scientifique, ce qui lui a permis de renouer avec sa passion pour l’écriture. Et quoi de mieux qu’une collaboration avec un artiste pour rendre la science accessible à tous ? Yohan Colombié-Vivès est né à Auch. Après son diplôme d’architecture et d’habitat, il travaille durant quatre ans au sein d’un cabinet d’architecte en tant que collaborateur. Mais la passion qu’il éprouve depuis toujours pour le dessin ne l’a pas quitté. Bien au contraire ! Plus le temps passe, et plus elle grandit. C’est chez lui, entre des piles de plans et d’illustrations, qu’une idée va germer dans sa tête : devenir illustrateur ! Diplômé depuis d’un cycle professionnel d’illustration à l’IPESAA à Montpellier, il se consacre depuis 2015 à l’illustration et à la bande dessinée dans son atelier, dans le Tarn-et-Garonne.
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Un ouvrage de la collection Carnet de labo, dirigée par Pierre-Étienne Bertrand
Tous droits de traduction, d’adaptation et de reproduction par tous procédés, réservés pour tous pays. La loi du 11 mars 1957 n’autorisant, aux termes des alinéas 2 et 3 de l’article 41, d’une part, que les « copies ou reproductions strictement réservées à l’usage privé du copiste et non destinées à une utilisation collective », et, d’autre part, que les analyses et les courtes citations dans un but d’exemple et d’illustration, « toute représentation intégrale, ou partielle, faite sans le consentement de l’auteur ou de ses ayants droit ou ayants cause est illicite » (alinéa 1er de l’article 40). Cette représentation ou reproduction, par quelque procédé que ce soit, constituerait donc une contrefaçon sanctionnée par les articles 425 et suivants du Code pénal.
Imprimé en France par SEPEC, 01960 Péronnas ISBN (papier) : 978-2-7598-2547-9 ISBN (ebook) : 978-2-7598-2607-0 Dépôt légal : mai 2021 © EDP Sciences, 2021 17, avenue du Hoggar 91944 Les Ulis